Molecular identification of Fusarium isolates associated with passion fruit in five locations from Valle del Cauca, Colombia.

Authors

  • Edwin David Henao-Henao Universidad Nacional de Colombia, Sede Palmira http://orcid.org/0000-0002-0423-4168
  • Carlos Alberto Hernandez-Medina Universidad Nacional de Colombia
  • Claudia Salazar-González Universidad de Nariño
  • Martha Lucia Velasco-Belalcazar Universidad Nacional de Colombia
  • Eyder Daniel Gómez-López Universidad Nacional de Colombia

DOI:

https://doi.org/10.15517/ma.v29i1.27114

Keywords:

fusariosis, Passiflora edulis, fungal diseases, genetic variation.

Abstract

The passion fruit’s production in Colombia has shown great advances; however, phytosanitary diseases remain as issues in passion fruit production. This includes the pathogens that hinder the establishment and development of the crop, such as some species of the genus Fusarium, pathogen considered as an important one because of the economic losses that it generates. The objective of this work was to molecularly identificate the populations of Fusarium associated with passion fruit (Passiflora edulis). Between January and December 2015, an isolation of 35 samples based on different affected organs of the plant and from localities found in five municipalities was performed in Valle del Cauca, Colombia. Eight isolates were selected and purified in order to perform their DNA’s extraction and also an amplification of region TEF 1 alpha. The PCR products were sequenced and compared with the NCBI database and Fusarium ID. The results obtained by sequencing showed that the isolates belong to Fusarium incarnatum, Fusarium solani, and Fusarium proliferatum, the first species had a mayor occurrence in the tested samples. The analysis of phylogenetic relationships was achieved by using the 6 MEGA program, and by using the similarity coefficient nearest neighbor, which allowed to observe the variability among the evaluated isolates.

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Author Biographies

Edwin David Henao-Henao, Universidad Nacional de Colombia, Sede Palmira

Nacido el 2 de abril de 1994 con nacionalidad Colombiana, graduado de secundaria en el año 2010 como mejor estudiante tecnico agropecuario, a la fecha es autor y editor de 14 libros de diagnostico fitosanitario en frutales, 1 articulo cientifico en la revista Fitopapatologia Colombiana, de la Asociacion Colombiana de Fitopatologia y 5 trabajos cortos, con ponencias en congresos nacionales e internacionales. Cuenta con filiacion al grupo de Investigacion Proteccion Vegetal para el Mejoramiento de la productividad, categoria A COLCIENCIAS. Y actualmente  se encuentro realizando actividades en el Centro de Investigacion en Palma de Aceite (CENIPALMA) en el programa de plagas y enfermedades.

Carlos Alberto Hernandez-Medina, Universidad Nacional de Colombia

Biologo de la Universidad del Valle (Colombia) y Magister en Proteccion de Cultivos de la Universidad Nacional de Colombia. Profesor Catedratico de la Universidad del Valle.

Claudia Salazar-González, Universidad de Nariño

Ingeniera Agronoma, Magister en Ciencias Agrarias, y Doctora en Ciencias Agrarias Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. 

Profesora Asociada de la Universidad de Nariño

Martha Lucia Velasco-Belalcazar, Universidad Nacional de Colombia


Biologa de la Universidad del Valle, Maestria en proteccion de Cultivos, de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, y actualmente se encuentra vinculada al Instituto Colombiano Agropecuario (ICA).

Eyder Daniel Gómez-López, Universidad Nacional de Colombia

Ingeniero Agronomo de la Universidad Nacional de Colombia, con Maestria en Suelos de la misma universidad y Doctorado en Biotecnologia de la Universidad Politecnica de Valencia. Actualmente es profesor asociado de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira y secretario de sede de la misma Universidad y categorizado como Investigador Senior por Colciencias. Es director del grupo de investigacion Proteccion Vegetal para el Mejoramiento de la Productividad, Categoria A Colciencias.

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Published

2018-01-01

How to Cite

Henao-Henao, E. D., Hernandez-Medina, C. A., Salazar-González, C., Velasco-Belalcazar, M. L., & Gómez-López, E. D. (2018). Molecular identification of Fusarium isolates associated with passion fruit in five locations from Valle del Cauca, Colombia. Agronomía Mesoamericana, 29(1), 53–61. https://doi.org/10.15517/ma.v29i1.27114

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